Maya ve maya benzeri mantarların sekans analizi ile identifikasyonu Dr. Ayşe KALKANCI Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Ankara 24-25 Şubat 2011, İzmir Sunum Planı • Teorik bilgi (20 dk) • Örnekler (15 dk) • Tartışma (10 dk) Sekans analizi nedir ? DNA baz dizilimlerinin belirlenmesi DNA RNA Şeker D-deoksiriboz D-riboz Asit Fosforik asit Fosforik asit Baz A, T, G, C A, U, G, C Bazlar Pürin Pirimidin • Adenin • Sitozin • Guanin • Timin • Nükleozid = Baz + Şeker Glikozid bağı ile birleşir, aradan su çıkar • Nükleotid = Fosfat + Şeker + Baz Nükleotidler • DNA ve RNA yapı taşıdır Sekans (DNA dizi) analizi yöntemleri 1. Kimyasal (Maxam-Gilbert) 2. Enzimatik (Sanger) 3. Pirosekanslama Kimyasal yöntem • DNA molekülü kinaz enzimi ile 5’ fosfat ucundan 32P ile işaretlenir. • Seçici olarak 4 bazı parçalayan kimyasal maddeler kullanılarak farklı uzunluklarda DNA parçaları elde edilir. • Elektroforezle ayrılan bantlar otoradyografi ile incelenir. Maxam A & Gilbert W. 1977